Structura organizatorică a Primăriei Sectorului 6 este în conformitate cu Hotărârea Consiliului Local nr. 104 adoptată în şedinţa din 14.07.2011 privind aprobarea Organigramei şi a Statului de funcţii ale aparatului de specialitate al Primarului Sectorului 6.
Principalele tipuri de relaţii funcţionale şi modul de stabilire al acestora se prezintă astfel: